nano LC-MS/MSによる受託プロテオーム解析
In gel digestion法、In Solution digestion法を用いて、ペプチドに断片化した目的タンパクを、MS/MS解析(検出されたピークを自動的にMS/MS)後、Agilent
Spectrum Mill検索ソフトによるタンパク質同定を行います。
この解析システムでは、複数ペプチドの MS/MSデータを自動検索するため、タンパク質同定の信頼性は極めて高くなります。なお、データベース(最新のNCBInr,
SwissProt )に登録されていない配列は、タンパク質同定ができません。また、調製済みのサンプル持込となっていますので、あらかじめご了承下さい。
予約方法
:担当者に予約状況を確認して予約してください。依頼書の提出が必要。
田丸聖治
内線:7472
E-Mail:ktamaru@md.okayama-u.ac.jp
◆依頼書1(pdf)
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使用料金
:サンプル 15,000円/1サンプル
検索 300円/30分
サンプル容器 100円/1本
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使用分析装置
:Agilent 1100LC/MSD Trap XCT Ultra (HPLC-Chip-MS)
カラム=Zorbox 300SB-C18(43mm×75μm,5μm)
エンリッチメントカラム= Zorbox 300SB-C18(40nL,5μm)
サンプル :溶液(トリプシン等でペプチドに断片化した物)※1
必要サンプル量 :10fmol以上(液量で、最低10μL 以上、また注入量の3倍以上必要、5μL注入の場合
20μL程度)※2
※1 サンプルの調製方法はこちら(Agilentのキットを用いた場合)
◆英語(Agilent Protein In-Gel Tryptic)キット添付説明書(pdf)
◆日本語(ゲル内消化、液中消化)(pdf)
※2 注入量の3倍以上ないサンプルは、原則として受け付けません。
Agilent 1100LC/MSD Trap XCT Ultra (HPLC-Chi--MS)