test


(旧)裏メインページ<非公式>
公式が新しくなったためあまり意味はありません。
公式が物足りないので作っちゃった…
管理者のメモ書きです、、、

お知らせ


 

共同実験室の機器の補足説明 (自分のわかる範囲で説明します)

機器の簡易マニュアルはこちらに集まっています
(下記説明欄の本アイコンからもダウンロードできます)
説明欄のPCアイコンは専用ソフトのダウンロードができます

Quick Link
顕微鏡関連     レーザー顕微鏡   オールインワン顕微鏡   蛍光顕微鏡   実体顕微鏡   Imaris   各種ソフトウェアOS対応状況
遠心機関連     超遠心機   冷却高速遠心機
光度計関連     分光光度計   蛍光光度計   マルチプレートリーダー   蛍光スキャナー
核酸関連      DNAシーケンサー   Genetyx   DNAマイクロアレイ   リアルタイムPCR   サーマルサイクラー   遺伝子導入装置
細胞関連      セルソーター   フローサイトメーター   セルカウンター
蛋白関連      LC-MS   TOF-MS   Mass Array   GC-MS   ペプチド合成機   液クロ
電顕関連      透過電子顕微鏡   走査電子顕微鏡   ミクロトーム   蒸着装置
フォトセンター    大型ジェットプリンタ   スキャナ   ビデオコピー   X線フィルム自動現像装置   証明写真作成
組織標本作製     パラフィンブロック作製   薄切   染色
その他、設備等     凍結乾燥機   濃縮遠心機   製氷機   純水製造装置   フリーザー   低温実験室   ウイルススキャン
 

機器予約状況   利用申込提出状況
 



顕微鏡関連
共焦点レーザー顕微鏡 LSM780
CarlZeiss
Confocal Laser Scanning Microscope 
LSM780
Carl-Zeiss-Promenade 10
07745 Jena, Germany
Phone: +49 3641 64-0
Fax: +49 3641 64-2856
URL:http://www.zeiss.de/

2022年9月サポート終了の為、以降修理不能
 
購入日:2013年2月
設置場所:融合棟5F レーザー顕微鏡室(手前)
倒立顕微鏡 Axio Observer.Z1
付属:XY電動ステージ
付属:ステージに乗せるタイプの簡易インキュベーター付
付属:ビジュアライゼーションソフト Imaris 7.6(Basic機能のみ) 

使用前に2時間程度の講習を受けていただく必要があります。
講習は随時行っていますのでご連絡ください。

レーザー顕微鏡は蛍光顕微鏡にレーザー検出器が付いたものです。
共焦点蛍光像とはピントが合っていない光を取り除いて検出された蛍光像です。
共焦点蛍光像が取れることが蛍光顕微鏡との大きな違いです。
また、フォーカス面を変えながら画像を取得し、再構築することで
立体蛍光像を構築できます。
ステージマウントを取り換えることでスライドディッシュマルチプレートが使用できます。
インキュベーターで使用できる容器は35mm及び60mmディッシュのみです。

<特徴>
5〜63倍での明視野(微分干渉)、共焦点蛍光像の取得が可能
5Laser搭載
32ch GaAsPスペクトルディテクター搭載のため高感度
取得可能な蛍光はHoechst(青)からCy5(近赤外)まで
(赤外域の撮影はBZ-X700がお奨めです)
フィルターレスのため自由な蛍光波長を設定可能(400nmから750nmくらいまで)
スペクトルディテクター搭載のため分光やunmixが可能
(411nmから691nmを8.7nm刻みで1scanで画像化)
unmixとはスペクトルの違いを利用しフィルターで分離できない近似色の蛍光や
自家蛍光を分離する画像処理です
スペクトルディテクターをバーチャルフィルターとして使用し、最大10色の蛍光像を取得可能
連続切片像から蛍光立体像を構築可能
タイムラプス測定可能(簡易インキュベータのため長時間は不可)
電動ステージを使ったタイリングや多点測定
高輝度と低輝度のサンプルを1フレームにおさめるHDR撮影
蛍光相関分光法(FCS)ができるらしい(詳細不明)

詳細
レンズ:(乾燥PlanApo)x5,x10,x20,x40
(油浸PlanApo)x63 (水浸C-Apo)x63
画質は油浸>水浸>乾燥、扱い易さは乾燥>水浸>油浸です
(プラ底のものはx10程度まで)
(ArrayScanが空いていればLD x20も借りれます)

目視用透過光源:ハロゲンランプ
目視用蛍光光源:メタルハライド
画像取得用Laser:Violet(405nm),Ar(488,514,458nm),DPSS(561nm),HeNe(594,633nm)
検出器:PMT 2個(長波長側は冷却PMT)、32ch GaAsP PMT 1個、透過用PMT 1個

この装置で使用できそうな蛍光色素(条件的にやや不利なものを含んでいます)
DAPI,Hoechst,FITC,GFP,Alexa[405,488,514,568,633,635,555,594,647],Cy[2,3,5],
MitoTracker [Green,Orange,Red,DeepRed],Cascade [Blue,Yellow],Pacific [Blue,Orange],
Rhodamine,TRITC,TexasRed,PE,PI,YFP,SYTO[9,13,14,15,16,21,24,84,85],Qdot

ユーザーからの報告でRhodamine,Cy3,TRITC,Alexa555はLSM510の方がむいているようです。
(560nm付近が取得できないのがよくない?)

こちらに蛍光色素のスペクトルを確認できるHPがあります。

蛍光色素についてはメーカー等により若干スペクトル特性が変わります。
必ず、ご自分が使われているメーカーで特性を確認して下さい。
 

2020/12/22
Black editionのリンクがないようです。
必要な方は共同実験室で借りてください。
ZeissのホームページよりフリーのビューアーZEN Liteがダウンロードできます。
 ※64bit Windows専用、Mac版はありません。
 ※32bit版はレーザー顕微鏡用ではありません。

2020/8/27
ZEN2012がインストールできないPCが増えているようです。
インストールできない場合は3.0が安定していますのでそちらをお使いください。

2019/6/27
ZEN 3.0 Black SRが公開されています。

2018/5/25現在 ZEN2.3のサイズが7GBになっていました。
ダウンロードが終わらない方は共同実験室までご連絡ください。

2017/9/6現在 ZEN 2.3SP1 Black editionが公開されています。
自分がテストしたところ動作が不安定でした。
ZEN2012の方がよさそうです。

旧バージョンが必要な方はダウンロード画面が表示されたらZEN2012(32bit版)の
ダウンロードアドレスのファイル名部分を以下のように書き換えてください。
ZEN2012 Liteが欲しい方 … ZEN_2012SP1_black_SP2_blue.exe
ZEN2009 Liteが欲しい方 … ZEN_2009_Light_Edition.exe
旧バージョンが必要でダウンロードが分らない方は共同実験室までご連絡ください。
 

fee

LSM780(本体)
 


ZEN lite (ビューア)最新版ダウンロード先
最新版のZENではLSM780用のソフトが
含まれていません。
以下のリンクを使用するか
共同実験室でソフトのコピーを
取得してください。


ZEN 2012 liteへのリンク
(直リンのため学内限定)

ZEN 2012がインストールできない方は
ZEN 3.0 Black SRを借りてください
 


ZENデフォルトパラメーター
(3D表示がおかしい時に
3D-SeriesのLoadで読み込んでください)
 

 


臨海実験所の多光子レーザー顕微鏡を見てきました。
 
 
 

 

共焦点レーザー顕微鏡 LSM510
CarlZeiss
Confocal Laser Scanning Microscope 
LSM510
Carl-Zeiss-Promenade 10
07745 Jena, Germany
Phone: +49 3641 64-0
Fax: +49 3641 64-2856
URL:http://www.zeiss.de/

メーカーサポート終了のため故障時修理不可
購入日:1999年11月
設置場所:融合棟5F レーザー顕微鏡室(奥)
正立顕微鏡 AxioPlan2 Imaging
付属:CCDカメラ Olympus DP50
付属:画像処理装置 CarlZeiss Imaris System 

使用前に2時間程度の講習を受けていただく必要があります。
講習は随時行っていますのでご連絡ください。

<特徴>
10〜100倍での明視野(微分干渉)、共焦点蛍光像の取得が可能
Ar Laser(488,514,458nm)とHeNe(543nm)Laser搭載
取得可能な蛍光は主にFITC(緑),YFP(黄),Rhodamine(赤)等、及び微分干渉像
連続切片像から蛍光立体像を構築可能
タイムラプス測定可能(連続切片像取得プログラムとの併用不可)
顕微鏡が正立顕微鏡のためディッシュ等での観察にはむかない
付属の画像処理装置でデコンボリューション処理が可能
ZeissのホームページよりフリーのビューアーLSM 5 Image Browserがダウンロードできます。
※Windows用、Mac版はありません。
(ZENもLSM510用のビューアーとして使用できます)

詳細
レンズ:(乾燥PlanNeo)x10,x20,x40 (乾燥PlanApo)x20
(油浸PlanNeo)x40,x100 (油浸PlanApo)x63
(水浸C-Apo)x63 (水没Achroplan)x40
画質は油浸>水浸>乾燥、扱い易さは乾燥>水浸>油浸です
目視用透過光源:ハロゲンランプ
目視用蛍光光源:水銀ランプ

この装置で実際に使用された蛍光色素(黄字は条件的に不利なもの)
FITC,GFPAlexa488,SYBRGreen,Cy2,Fluo-3
Rhodamine,TexasRed,PE,Cy3,PI,CellTrackerRed,Alexa546,Alexa555,Alexa568,Alexa594,TRITC,DsRed2
(観察、CCD取り込み可能、LSM画像取得不可)DAPI,Hoechst

測定中にLSM透過像の明るさが変わる持病を持っています(蛍光像は問題有りません)
(ファイバーの劣化のようです)
 
 
 

 

fee

LSM510
 


Image Browser

オールインワン蛍光顕微鏡 BZ-X700
KEYENCE
All-in-one Fluorescence Microscope
BZ-X700
大阪市東淀川区東中島1-3-14
URL:http://www.keyence.co.jp/

購入日:2014年10月
設置場所:融合棟5F 光学顕微鏡室(正面奥) 
 

倒立顕微鏡
透過光源:白色LED
蛍光光源:メタルハライド
高感度モノクロ冷却CCD搭載
対物レンズ:純正 x2 , x4Ph , x10Ph , x20 , x20Ph , x40 , x40Ph , x100oil
        非純正 x5(Zeiss) , x40(Zeiss) , x40oil(Zeiss) , x100oil(Olympus)
(最大6本セット可能)
純正レンズが揃いました
ツァイスレンズでは色によってピントずれがおこります
蛍光フィルター: 詳細なフィルター特性はメーカーHPをご覧ください
DAPI (Ex:360/40 , Dic:400 , Em:460/50)
GFP (Ex:470/40 , Dic:495 , Em:525/50)
TRITC (Ex:545/25 , Dic:565 , Em:605/70)
TexasRed (Ex:560/40 , Dic:585 , Em:630/75)
Cy5 (Ex:620/60 , Dic:660 , Em:700/75)
Cy7 (Ex:670-745 / Em:LP770) ※カスタムフィルター(Olympus社製)
ICG (Ex:775/50 , Dic:810 , Em:845/55) カスタムフィルター(Chroma社製)

特殊なフィルターは各自ご用意ください。
カスタムフィルターとして、オメガ、クロマ、セムロック社のフィルターが使用可能です。

ハイブリッドセルカウントソフト搭載
タイムラプスモジュール追加 (2019.2.15)

筐体が簡易暗室のようになるため暗室不要。
接眼を持たないため観察から撮影まですべてPC上で行います。
ステージ移動時以外の励起光を遮断し、退色を抑えます。
CCDによる明視野、位相差、蛍光撮影が可能。
(最大4色まで同時使用可能、交換により4色以上使用可能)
赤外域の感度がいい。
特殊な機構によりカラー撮影も可能。
ステージホルダを交換することでプレパラート、ディッシュ、
フラスコ、マルチプレートが使用可能。
(マルチプレートの外周wellはwell全体の撮影ができません)
高速オートフォーカスが可能。
電動ステージによるタイリング撮影が可能。
低倍のタイリングイメージから高倍のマクロ撮影に移行可能。
Zフォーカスを動かすことでフルフォーカス撮影が可能。
位置を記憶し、多点撮影が可能。
サンプルをホルダにはめ込んだ状態で撮影し、座標も記録するので
後日同じ場所を探すことが可能。

ハイブリッドセルカウントを使用し、細胞数のカウント、面積、輝度値等の定量測定が可能。
※アプリケーションによりかなり設定、使用方法が変わります。
使い方が複雑なため、メーカー同伴での使用をお勧めします。

プレパラート、ディッシュ、マルチプレートが使えるCO2チャンバー。
長時間の一定間隔撮影可能。
動画撮影可能。

メーカーHPより解析ソフトの180日体験版がダウンロードできます。
ver1.3.1でWindows10 64bitに対応したようです。
※Windows7 64bit専用、Mac版はありません。
※Windows8,10の方はこちらの手順でインストールできます。(使用は自己責任で)
180日間はハイブリッドセルカウントを含むフル機能がご自分のPCで使用できます。
体験版発行コード:644375413
 
 

 

fee

BZ-X700
 


BZ-X Analyzer

蛍光実体顕微鏡 SZX12
OLYMPUS CORPORATION
stereoscopic microscope
SZX12
東京都新宿区西新宿2-3-1 新宿モノリス
Phone: (03) 3340-2111
URL:http://www.olympus.co.jp/jp/

購入日:2003年7月
設置場所:融合棟5F 光学顕微鏡室(手前)
付属:CCDカメラ Olympus DP72 
 

7〜90倍(無段階)での透過、落斜明視野像及び落斜蛍光像の取得が可能
取得可能な蛍光は主にDAPI(青),FITC(緑),Rhodamine(赤)等、及び明視野像
フィルター波長
Ex:330-385 / Em:420-
Ex:460-490 / Em:510-
Ex:460-490 / Em:510-550
Ex:510-550 / Em:590-
取得可能サイズは約24mm x 18mm 〜 2mm x 1.5mm
落斜照明があるため立体物の撮影に向いています
逆にプレパラート等はオールインワン顕微鏡の方が綺麗に撮影できます

memo:DP-BSWはWin7でも動作しそう
USBキーのドライバをアップデートすればWin10でも動作した
(Win7インストール→BSWインストール→Win10へアップグレード→最新HASPドライバインストール)
 
 
 

 

fee
fee

SZX12 & CCDカメラ
倒立蛍光顕微鏡 IX71
OLYMPUS CORPORATION
Inverted Microscope
IX71
東京都新宿区西新宿2-3-1 新宿モノリス
Phone: (03) 3340-2111
URL:http://www.olympus.co.jp/jp/

2022年9月サポート終了の為、以降修理不能

購入日:2002年2月
設置場所:融合棟5F 光学顕微鏡室(真ん中)
倒立型蛍光顕微鏡
付属:CCDカメラ オリンパス DP70 
 

対物レンズ:
UPlanFl 4x/0.13 PhL
UPlanFl 10x/0.30 Ph1
LCPlanFl 20x/0.40 Ph1
LCPlanFl 20x/0.40
LCPlanFl 40x/0.60 Ph2
LCPlanFl 60x/0.70 Ph2

フィルター:
NU Ex:330-370 / Em:LP420
WIB Ex:460-490 / Em:LP510
NIBA Ex:470-490 / Em:510-550
WIG Ex:520-550 / Em:LP580
Cy5 Ex:590-650 / Em:660-735 
TXRED Ex:545-580 / Em:LP610
Cy7 Ex:670-745 / Em:LP770

4〜60倍での明視野、位相差、蛍光観察が可能。
撮影可能な蛍光は主にDAPI(青)からCy5(近赤外)まで。
Cy7はカメラで撮影不能なようです。
1.6倍の変倍装置付。
 
 
 

 

fee
fee

IX71 & CCDカメラ
正立蛍光顕微鏡 Axiophot
CarlZeiss
Upright Microscope
Axiophot
Carl-Zeiss-Promenade 10
07745 Jena, Germany
Phone: +49 3641 64-0
Fax: +49 3641 64-2856
URL: http://www.zeiss.de/

購入日:1997年3月
設置場所:融合棟5F 光学顕微鏡室(奥)
正立型蛍光顕微鏡
付属:CCDカメラ オリンパス DP72
 

対物レンズ:
Plan-Neopluar 5x/0.15
Plan-Neopluar 10x/0.30 Ph1
Plan-Neopluar 20x/0.50 Ph2
Plan-Neopluar 40x/0.75 Ph2
Plan-Neopluar 100x/1.30 Ph3
Plan-Neopluar 100x/1.30

フィルター:
Ex:353-377 / FT395 / Em:LP397
Ex:450-490 / FT510 / Em:515-565
Ex:510-560 / FT580 / Em:LP590 

5〜100倍での明視野、位相差(10x〜100x)、蛍光観察が可能
撮影可能な蛍光は主にDAPI(青),FITC(緑),Rhodamine(赤)等
変倍装置付。(1.0x、1.25x、1.6x、2.0x)
 
 
 

 

fee
fee

Axiophot & CCDカメラ
細胞タイムラプス顕微鏡 CytoWatcher FL
ATTO
Time-lapse live cell imaging system
WSL-1800-B CytoWatcher FL
東京都台東区元浅草3-2-2
Phone: 03-5827-4861
Fax: 03-5827-6647
URL: https://www.atto.co.jp/

購入日:2020年10月
設置場所:融合棟5F 
倒立型顕微鏡

対物レンズ:4倍固定(デジタルズーム1〜4倍)
カメラ:500万画素CMOS
視野:1.425mm×1.070mm
光源:白色LED
観察、撮影:明視野及び緑色蛍光
画像フォーマット:TIFF,BMP,JPEG

蛍光ユニット
光源:青色LED(465nm)
励起:SP 480
蛍光:BP 525/45
 

小型簡易顕微鏡のため普段お使いのCo2インキュベーターに入れて
タイムラプス撮影が可能。
顕微鏡ごとインキュベーターに入れるため温度変動が起こりにくい。
タイムラプス撮影時は撮影時のみ光が照射される。
対物は位相差に対応していませんが、それなりに写ります。
蛍光ユニットを使用することで明視野とGFP等の緑蛍光のタイムラプス撮影が可能。
貸出用PCを用意していますが、取り込みソフトも貸し出しますので
ご自身のPCに直接取り込みも可能です。
画像撮影専用で解析等はできません。

 

fee

CytoWatcher
ビジュアライゼーションソフト Imaris
BITPLANE
3D Data Visualization
Imaris
Badenerstrasse 682 CH-8048 Zurich Switzerland
URL:http://www.bitplane.com/

購入日:2001年2月(Imaris3)、2013年2月(Imaris7)、2020年9月(Imaris9.6)
設置場所:融合棟5F データ解析スペース(レーザー顕微鏡室前) 
 

Imaris9.6(Windows)
各社のレーザー顕微鏡で取得したZスタック画像から立体像や3Dモデルを構築します。
FilamentTracerによりフィラメント構造のサンプルから3Dモデルを作成し、分岐や長さの解析ができます。
MeasurementProにより3Dモデルの体積や表面積などが計測できます。

Imaris7 (Windows)
レーザー顕微鏡で取得したZスタック画像から様々なタイプの立体像を構築します。
レーザー顕微鏡付属のソフトではできない複雑な動作の動画を作成できます。
 

2015年2月〜
機器有効利用のため他の解析ソフトもインストールしました。
Imarisの他に下記のソフトも使用可能です。
(共同実験室設置PCのOSはWin7 64bitです)

2015年5月〜
解析用PCを増設しました。

2020年9月〜
Imaris9.6が導入されました。
Imaris3はアップグレード元となったため削除されました。
 

設置時に他バージョンのOSでも動作を確認してみました。
各自でインストールされる場合の参考にしてください。

fee


 

OS対応状況 ◎…メーカー対応確認済 ○…共同実験室では動作 △…一部難あり ×…動作不可 

Imaris7(Zeissレーザー顕微鏡用立体構築ソフト) 
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル

Imaris 9.6
ImarisMeasurementPro
FilamentTracer
32bit×/64bit× 32bit×/64bit× 32bit×/64bit◎
Imaris 7.6.5 32bit○/64bit◎ 32bit○/64bit× 32bit○/64bit×
Imaris7.6
※テスト機に対応ビデオカードがないのでインストールまでの確認。
 

ZEN(Zeissレーザー顕微鏡用ビューア) free
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
ZEN 3.0 Black SR
※64bit専用
64bit- 64bit- 64bit◎
ZEN2012(Black.)
※64bit専用 (安定ver)
64bit◎ 64bit○
要WindowsUpdate
64bit○?
ZEN
ZEN2009.LightEdition. 32bit◎/64bit○ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○
ImageBrowser v4.2 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○
Image Browser
※ZEN2.3は3Dが不安定でした。
※ZEN2012はWin10にインストールできる場合とできない場合がありました。
2019/6/27 ZEN 3.0が出ていました。2.3より安定していましたが短時間使用の為、詳細不明です。
2020/12/22 Black editionの配布がなくなったようです。
 

BZ-X Analyzer(BZ-X700用解析ソフト)180日体験版
発行コード:644375413 Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
BZ-X Analyzer v1.4.0.1
※64bit専用
64bit◎ 64bit○ 64bit◎
BZ-X700
BZ-X Analyzer v1.2
※64bit専用
64bit◎ 64bit○
要DriverUpdate
64bit○
要DriverUpdate
※v1.2をWin8.1/10にインストールするにはインストール中に最新のHASPドライバに置き換えるとインストールできました。
手順はこちら
 

ND-1000(Nanodrop用データビューア) free
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
ND-1000 v3.8.1 32bit◎/64bit◎ × ×
ND-1000
ND-1000 v3.3.0 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit×
※Win8.1/10はセットアップ中にできるファイルを手動で全て入れると動作しました。
 

SoftMaxPro5.4(FlexStation3用解析ソフト)
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
SoftMaxPro5.4 32bit◎/64bit◎ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○
SoftMax

 

SequenceScanner(DNAシーケンサー用データビューア) free
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
SequenceScanner V1. 32bit◎/64bit○ 32bit△/64bit△ 32bit○/64bit○
Sequence Scanner
SequenceScanner V2 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○
※64bitはインストール時警告が出ます
 Win8.1はエラーがでますが、msvcp71.dllを入れると使えます。
 

StepOneSoftware(リアルタイムPCR用解析ソフト) free
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
StepOneSoftware v2.2. 32bit◎/64bit◎ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○
StepOnePlus
※バージョンが違うと問題が起こることがあります。なるべくv2.2を使用してください。
 

Genetyx(遺伝子解析ソフト)
ライセンスは各自申請して取得してください。詳しくはこちらまで。
共同実験室設置のPCではアカウント登録なしでも使用できるようにしています。(有料)
Win7 Win8.1 Win10
Genetyx v13 32bit◎/64bit◎ 32bit◎/64bit◎ 32bit◎/64bit◎

 

FlowJo(フローサイト用解析ソフト)
受付でライセンスキーを借りてください。
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
FlowJo v7.6.5(32bit)
貸出用ライセンス2本
32bit◎/64bit○ 32bit△/64bit△ 32bit△/64bit△
FlowJo v7
FlowJo v10.2
貸出用ライセンス1本
32bit◎/64bit◎ 32bit◎/64bit◎ 32bit◎/64bit◎
FlowJo v10
※v7.6.5をWin8.1,10にインストールするにはインストーラをWin7互換モードにする必要があります
 

FCAP Array(フローサイト用解析ソフト)
Win7 Win8.1 Win10
FCAP Array 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○

 

MACSQuantify(フローサイト用解析ソフト)
Win7 Win8.1 Win10
MMACSQuantify. 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit○

 

ImageLab(ChemiDoc用解析ソフト)
Win7 Win8.1 Win10 簡易マニュアル
ImageLab v6.0.1 32bit◎/64bit◎ 32bit○/64bit○ 32bit○/64bit◎
ImageLab

----- 以下SGI用の旧バージョンソフトです -----
SGI O2も設置されていますので以下のソフトも使用可能です。

2020.09.17
バージョンアップグレードに伴いImaris3及びNeuronTracerは削除されました。
後継はWindows版Imaris9.6,ImarisMeasurementPro,FilamentTracerになります。

Imaris3 (SGI)
SGI Irix上で動作する旧バージョンのImaris
複雑な動画が作成できませんが、オブジェクトの体積を計算する機能があります
古いシステムのため大きな画像は扱えません

Neuron tracer (SGI)
Zスタック画像から解析用モデルをつくり、樹状突起のつながりを
調べるソフトのようですがあまりうまくいきません

Huygens (SGI)
LSM510用のデコンボリューション処理を行うソフト
Zスタック画像からボケを除去します
かなり時間がかかります
古いシステムのため大きな画像は扱えません
LSM780の画像にはあまり効果がないようです
 
 
 
 
 
 

遠心機関連
超遠心機 L70K
BECKMAN
Ultracentrifuge
Optima L70K
Beckman Coulter, Inc.
Corporate Headquarters
4300 N. Harbor Boulevard
P.O.Box 3100
Fullerton, CA 92834-310
URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/

購入日:1998年3月
設置日:2015年3月供用換え、2015年6月使用開始
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(実験台向かって右側) 
 

最高回転数:70,000 rpm 
温度調整:0 〜 40℃

保有ローター … ANGLE型 Type70.1Ti , Type50.2Ti , Type60Ti, Type45Ti 
          SWING型 SW55Ti , SW41Ti , SW28
          VERTICAL型 NVT90 , VTi65.2
※取り消し線付きは基礎医学棟で保管しています。

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最大容量…(Angle) Type45Ti 70ml/本x6 , (Swing) SW28 38.5ml/本x6
最大遠心加速度…(Angle) Type70.1Ti 約450000g(ボトム) , (Swing) SW55Ti 約367000g(ボトム)

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
チューブキャップは高価なため共用する

ローターについて補足
Type70.1Ti、SW55Ti、SW41Ti、SW28は2つ保有しています
またL70K、XL80は同室に設置されているためこれらのローターは
2台同時使用が可能です
 
 
 

 

fee
   
L70K
超遠心機 XL-80
BECKMAN
Ultracentrifuge
Optima XL-80
Beckman Coulter, Inc.
Corporate Headquarters
4300 N. Harbor Boulevard
P.O.Box 3100
Fullerton, CA 92834-310
URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/

購入日:1994年3月
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(実験台向かって左側) 
 

最高回転数:80,000 rpm 
温度調整:0 〜 40℃

保有ローター … ANGLE型 Type70.1Ti , Type50.2Ti , Type60Ti , Type45Ti 
          SWING型 SW55Ti , SW41Ti , SW28
          VERTICAL型 NVT90 , VTi65.2
※取り消し線付きは基礎医学棟で保管しています。

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最大容量…(Angle) Type45Ti 70ml/本x6 , (Swing) SW28 38.5ml/本x6
最大遠心加速度…(Angle) Type70.1Ti 約450000g(ボトム) , (Swing) SW55Ti 約367000g(ボトム)

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
チューブキャップは高価なため共用する
 
 
 

 

fee
   
XL-80
超遠心機 L8-70M
BECKMAN
Ultracentrifuge
Model L8-70M
Beckman Coulter, Inc.
Corporate Headquarters
4300 N. Harbor Boulevard
P.O.Box 3100
Fullerton, CA 92834-310
URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/

購入日:不明
設置日:2001年11月 神経病態内科より供用換え
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室(正面奥)
 

最高回転数:70,000 rpm 
温度調整:0 〜 45℃

保有ローター … ANGLE型 Type70.1Ti , Type50.2Ti , Type60Ti , Type45Ti
          SWING型 SW55Ti , SW41Ti , SW28
          VERTICAL型 NVT90 , VTi65.2
※取り消し線付きは融合棟で保管しています。

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最大容量…(Angle) Type45Ti 70ml/本x6 , (Swing) SW28 38.5ml/本x6
最大遠心加速度…(Angle) Type70.1Ti 約450000g(ボトム) , (Swing) SW55Ti 約367000g(ボトム)

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
チューブキャップは高価なため共用する
 
 
 

 

fee
   
L8-70M
超遠心機 SCP85H
2021.02.05 ドライブ損傷し使用不能となりました
Hitachi
Ultracentrifuge
Model SCP85H
東京都港区港南二丁目15番1号(品川インターシティA棟)
電話(03)5783-0601
URL:http://www.hitachi-koki.co.jp/index.html

購入日:不明
設置日:2004年9月 病理病態学より供用換え
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室(右側)
 

最高回転数:85,000 rpm 
温度調整:0 〜 45℃

保有ローター … ANGLE型 RP80T-3 , RP55T , RP50-2 , RP45T , RP70T , RP83T
          SWING型 RPS65T , SRP28SA , RPS40T , RPS25-2
          VERTICAL型 SRP83VT

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最大容量…RP45T 94ml/本x6(アングル)、RPS25-2 60ml/本x3(スイング)
最大遠心加速度…RP83T 約616000g(ボトム)

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
チューブキャップは高価なため共用する
 
 
 

 

fee
   
SCP85H
超遠心機 80P-7
Hitachi
Ultracentrifuge
Model 80P-7
東京都港区港南二丁目15番1号(品川インターシティA棟)
電話(03)5783-0601
URL:http://www.hitachi-koki.co.jp/index.html

購入日:1979年2月
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室(左側) 
 

最高回転数:80,000 rpm
温度調整:-10℃ 〜 室温

保有ローター … ANGLE型 RP80T-3 , RP55T , RP50-2 , RP45T , RP70T , RP83T
          SWING型 RPS65T , SRP28SA , RPS40T , RPS25-2
          VERTICAL型 SRP83VT

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最大容量…RP45T 94ml/本x6(アングル)、RPS25-2 60ml/本x3(スイング)
最大遠心加速度…RP83T,RP80T-3 約572000g(ボトム)

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
チューブキャップは高価なため共用する
 
 
 

 

fee

微量超遠心機 TL-100
BECKMAN
Ultracentrifuge
Model TL-100
Beckman Coulter, Inc.
Corporate Headquarters
4300 N. Harbor Boulevard
P.O.Box 3100
Fullerton, CA 92834-310
URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/

購入日:1989年3月
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(奥) 
 

最高回転数:100,000 rpm 
温度調整:2 〜 40℃

保有ローター … ANGLE型 TLA-100.3 , TLA-100.2

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最小容量…TLA-100.2 1ml/本x6
最大遠心加速度…TLA-100.3 約540000g(ボトム)

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
1.5mlマイクロチューブは必ず専用のものを使用してください。
 
 
 

 

fee
   
TL-100
冷却高速遠心機 7780U
KUBOTA
High Speed Refrigerated Centrifuge 7780U
東京都文京区本郷3-29-9 
Tel:03-3815-1331  Fax:03-3814-2574 
URL:http://www.kubotacorp.co.jp/

購入日:2010年8月
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(製氷機左側) 
 

最高回転数:22,000 rpm 
設定可能温度:-20〜40℃ 

保有ローター … RA-150,RA-300G,RA-1500,AG-6512C
RS-751GS(2012.8.2追加購入)
RS-720Gが追加で使用可能です
RA-***,AG-***はアングルローター、RS-***はスイングローターです

各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
最大容量…RA-1500 250ml/本 *6
最大遠心加速度…RA-150 約52000g(ボトム)

AG-6512C,RS-720Gは汎用50ml,15mlコニカルチューブ使用可能
(AG-6512Cは上限のgに注意)
RS-751GSはマイクロプレート使用可能

チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
 
 
 

 

fee
   
7780U
冷却高速遠心機 MRX-150
TOMY
High Speed Refrigerated Centrifuge
MRX-150
東京都練馬区田柄3-14-17
TEL.03-5987-3111
FAX.03-3577-1655
URL:http://bio.tomys.co.jp/

購入日:不明
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(製氷機左側) 
 

保有ローター … TMA-4
最高回転数:15,000 rpm 
容量…1.5mlx16本
最大遠心加速度…約19500g(ボトム)

ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい

チューブは各自で用意する

1.5mlマイクロチューブ専用機。
設定はダイヤルを回すだけ。
回転数計の表示が壊れています。
 
 
 

 

fee
密度勾配作製装置 グラジェントマスター106
Biocomp
gradient forming instrument
Gradient Master Model 106

URL:

購入日:2004年3月
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(TL-100横)
 

チューブを傾けて回転させることで密度勾配を作製します
Backman SW28,SW41Ti,SW55Ti用のアダプタがあります

 

fee


→  → 


 
 
 
 

光度計関連
分光光度計 DU-7400
Beckman
Spectrophotometer
DU-7400

URL:

購入日:1994年3月
設置場所:融合棟5F 分光分析室(ArrayScanの裏側)
 

測定範囲190nm-800nmの分光光度計
測定部分が解放型になっている
試料量50ulのマイクロセルを使って測定する
アレイ検出器を搭載しているため全域を瞬時に測定できる
固定波長測定、波長スキャンの他に核酸やタンパクを定量するモードを備える
結果はプリントアウトもしくはFDへの保存に限られる
 
 
 

 

fee

DU-7400
分光光度計 DU-640
Beckman
Spectrophotometer
DU-640

URL:

購入日:不明
設置場所:基礎医学棟1F 微量成分分析室(左側)→(移転予定地)旧RI棟3F 機器分析室2 
 

DU-7400の下位機種
違いは密閉型の試料部と検出器くらいでソフトウェア的にはほぼ同じになっている
ごく一般的な分光光度計
測定範囲は190nm-1100nm
試料部は通常の標準セル(4ml)仕様
結果はプリントアウト

故障しました
 
 
 

 

fee

DU-640
微量分光光度計 DS-11+
DeNovix
Spectrophotometer
DS-11+
3411 Silverside Rd
 Hanby Building
 Wilmington, DE 19810  USA
phone   +1 302 442 6911
URL:http://www.denovix.com/
 

購入日:2016年8月
設置場所:融合棟5F 分光分析室(入口左側) 
 

DU-7400とNanoDropの後継機種として購入
最小0.5ulで測定可能(標準キュベット使用時は約1ml必要)
キュベット使用可能(37-45℃で加温のみ可能)
(少量でしたらディスポのマイクロキュベットを共同実験室で在庫しています)
ものによっては測定部に入らないキュベットがありますので注意
Brand社の759200というマイクロキュベット(70ul〜)は使用可能でした
Eppendorf社のUVetteも使えそうです
マイクロキュベットを使う場合は、光路の高さ8.5mmのものを使用してください
キュベットでUVレンジを使用する場合は石英かUV対応のものを使用してください

光源:キセノンフラッシュ
検出部:2048画素CCD
波長レンジ:190-840nm
光路長:0.5mm (0.03mmまで自動変更)
最少ボリューム:0.5ul
吸光レンジ:0.015〜750AU(10mm 光路長換算)  0.04-500AU
0.75-37500ng/uL dsDNA  2-25000ng/ulのdsDNAが検出可能
0.04-1125mg/mL BSA  0.1-750mg/mlのBSAが検出可能
※ソフトウェアアップデートでスペックが上がりました

DNAやタンパクの定量モードを備える
PC不要
結果はUSBメモリへ保存する
プリントアウト不可
操作画面がNanodropによく似ているため迷わず使えます


キュベット吸光度比較



DS-11、ND-1000同一サンプル比較
 
 
 

 

fee

DS-11+

微量分光光度計 ND-1000
NanoDrop Technologies
Spectrophotometer
ND-1000
URL:http://www.nanodrop.com/
 

メーカーサポート終了のため故障時修理不可
購入日:2006年7月
設置場所:融合棟5F 分光分析室(DS-11+の横) 

最小1ulで測定可能
2-3700ng/ulの二重鎖DNAが定量可能
DNA,RNA,タンパク等の定量モードを備える
核酸定量専用機として使用中
蛋白も使用可能にしました
プリントアウト可能(有料)

光源:キセノンフラッシュ
検出部:2048画素CCD
波長レンジ:220-750nm
光路長:1mm (高濃度時0.2mm)
最少ボリューム:1ul
吸光レンジ:0.02-75AU(10mm 光路長換算)
2-3700ng/ul (dsDNA) , 3000ng/ul (RNA) , 2400ng/ul (ssDNA)
0.1-100 mg/ml (BSA)

上記のリンク先の
support-Nanodrop1000-softwareからソフトをダウンロードし、
データビューワーとして使用可能
 
 
 

 

fee

ND-1000
 


 

マルチプレートリーダー FlexStation 3
Molecular Device
MULTI-DETECTION READER
Flex Station 3
1311 Orleans Drive
Sunnyvale, CA 94089-1136
U.S.A.
Phone: (U.S.)   800-635-5577
URL:http://www.moleculardevices.com/home.html

購入日:2009年11月
設置場所:融合棟5F 分光分析室(左側奥) 
 

吸光、蛍光、発光、時間分解蛍光、蛍光偏光測定のできるプレートリーダー
ピペッターを内臓するため試薬添加可能(96ウェルのみ使用可能)
カイネティック測定可能、スペクトル測定可能
測定対応プレート:6〜384ウェル(プレートメーカーはグライナー推奨)
測定可能波長:200〜1000nm(吸光)、250〜850nm(蛍光)、250〜850nm(発光)
波長は1nm刻みの設定可能
温度調節:室温+4度〜45度(冷却はできません)

プレートを測るだけだと非常に簡単に使用できるためお奨めです。
波長設定をモノクロメーターで行うため1nm刻みで自由に設定できます。
感度は並のようですので高感度が必要なプロトコールには使えません
データはExcelに保存できます。
同一プレート内に検量線用スタンダードサンプルがあれば定量も可能です。
ペッターを内臓していますがあまり再現性はよくないようです。
(試薬が均一に混ざらないため?)
試薬を添加する場合はサンプルプレートとは別に試薬用のプレートを用意し、
そちらから移し取るようになりますのでデッドボリュームを含めると
かなりの試薬量が必要になります。
異色な機能として水溶媒にかぎり吸光度をOD値(10mmパス相当)に変換する機能もあります。

時間分解蛍光はあまり細かい設定はできません。
(DelayやIntegration timeは決まったものから選択します。Dual TR-Fは不可。)
時間分解蛍光は専用の試薬を必要としますが、バックグラウンド蛍光の影響を減らすことができます。
蛍光偏光は蛍光の垂直偏光成分と水平偏光成分を測ると目的分子が大きいか小さいかがわかるらしいです。
分かる方教えて下さい、、、
 
 
 

 

fee

FlexStation3

 
分光蛍光光度計 650-10S
Hitachi
Florence Spectrophotometer
Model 650-10S
東京都千代田区丸の内一丁目6番6号
電話 03-3258-1111
URL:http://www.hitachi-hitec.com/index.html

購入日:1983年3月
設置場所:融合棟5F 分光分析室(左側奥) 
 

感度:10 mm セル、励起光 350 nm 、バンドパス両分光器とも10nm において
    水のラマンがS/N 80以上 
光源:150 W キセノンランプ 
波長域: 220 〜 730 nm 
波長幅:2nm〜20nm

分光された励起光を試料に当て、蛍光測定する。
励起側、蛍光側共に分光器を使用しているため
波長域内は自由に設定できる。
マイクロセルを使用した場合の最小必要サンプル量は約100ul。
分光器をモーターで動かすことでスペクトル特性を記録できる。
PCに接続できないため、記録はメーターの目視、または
ペンレコーダーへの記録に限られる。
温度記録用機器を接続し、PCへのスペクトル記録をできるようにしました
 
 
 

 

fee

650-10S
原子吸光光度計 Z-9000
Hitachi
Simultaneaus Multi-element Analysis Atomic Absorption Spectrophoto Meter
Model Z-9000
東京都千代田区丸の内一丁目6番6号
電話 03-3258-1111
URL:http://www.hitachi-hitec.com/index.html

購入日:1991年3月
設置場所:基礎医学棟1F 微量成分分析室
 

測定方法:4波長ダブルビーム(偏光ゼーマン) 
原子化部:フレームレス(グラファイト炉) 
測定波長域: 190 〜 860 nm
保有ランプ:Ag,Al,Au,B,Ca,Cd,Co,Cr,Cs,Cu,Fe,Hg,K,Li,Mg,Mn,Mo,Na,Ni,Pb,Pt,Se,Si,Sn,Sr,Zn
(黄色のものは使用実績がありません。灰色のものは使えませんでした。)
販売されているランプは他に以下のものがあります。
As,Ba,Be,Bi,Ga,Ge,In,La,Nb,Pd,Rh,Sb,Ta,Te,Ti,V,W,Zr

液体サンプル10〜40ulを2000〜3000度で原子化し、ホローカソードランプの吸収で
濃度測定を行います。(定量には既知のスタンダードが必要)
サンプル中の4元素を同時に測れます。
偏光ゼーマン法によるバックグラウンド補正を行います。
予めランプをセットしないといけないため、どんな元素が含まれるか
解らないサンプルには使用できません。
オートサンプラが付いていますが、グラファイト炉のため測定回数に制限があります。
蛋白質等の不純物の多い生体試料の測定にはむいていません。

定量まで行うと結構時間がかかります、、、
 
 
 

 

fee

Z-9000

 
 

 
 
 
 

その他
細胞イメージアナライザー Cellomics ArrayScan VTI
Thermo Fisher Scientific Inc.
High-Content Systems
Cellomics ArrayScan VTI HCS Reader
81 Wyman Street
Waltham, MA 02454
Tel: 781.622.1000
        800.678.5599
Fax: 781.622.1207
URL:http://www.thermoscientific.jp/

購入日:2010年1月
設置場所:融合棟5F 分光分析室(入口正面)
 

顕微鏡観察とフローサイトメーターの間の子のような性格をもつ機械。
倒立顕微鏡とCCDカメラとXYステージの組み合わせで自動でプレート上のイメージを取得し、
細胞サイズ、形状、個数、差、比率などの数値データを統計的に出力する事を目的としている。
イメージ取得と同時に解析を行うリアルタイムアナリシス機能をもつためイメージ取得完了後、
すぐに解析データを見ることができる。
全イメージを一律の条件で解析するため客観的な解析データが得られる。
バイオアプリケーションを搭載して今までのものより条件設定が簡単になったらしいが
実際は条件設定が非常に難しい…。

レンズ:Fluar 5x , ECPlanNeo 10x , PlanApo 10x , LD PlanNeo 20x
 
 
 

 


 
 
fee
フルオロイメージアナライザー
FLA-3000
FUJIFILM
Fluorescent Image Analyzer
FLA-3000
東京都港区赤坂9丁目7番3号
Tel: 03-6271-1111
URL:http://fujifilm.jp/

購入日:不明
設置日:2015年6月(分子腫瘍学より)
設置場所:融合棟5F 蛋白質量分析室
 

蛍光イメージスキャナー。
蛍光染色したゲルのイメージ取り込みができます。
搭載するレーザーは473nm,532nm,633nm、
フィルターはY520,O580,R675(いずれもロングパス)から選択できます。
イメージングプレート(IP)は未対応のようです。
一応、濃度解析等を行うソフトが付いているようですが、
古いソフトのためあまり使わないようです。
 
 
 

 

fee

FLA-3000
イメージングシステム
ChemiDoc Touch
Bio-Rad
Imaging System
ChemiDoc Touch
1000 Alfred Nobel Drive
Hercules, CA 94547
Tel: +1-510-724-7000
URL:http://www.bio-rad.com

購入日:2018年6月
設置場所:融合棟5F 蛋白質量分析室

仕様
検出器:600万画素冷却CCD(-25℃)
最大撮影エリア:16.8cm x 21cm
ビニング、ズーム、オートフォーカス有
光源:透過型UV光源(302nm) 、 落射型白色光源

ウェスタンブロットメンブレンやゲルの撮影をします。
化学発光、蛍光撮影(UV励起のみ)、落射撮影対応。
撮影画像はUSBに保存できます。
PCに専用ソフトをインストールすることで解析も可能なようです。
(Windows , MAC対応)
 
 
 

 

fee

ChemiDoc Touch
真空冷凍乾燥機 FDU-2110
TOKYO RIKAKIKAI
Freeze Dryer
Model FDU-2110
東京都文京区小石川1-15-17 TN小石川ビル6F
電話 03(6757)3377
URL:http://www.eyela.co.jp/index.shtml

購入日:2017年8月
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室 
 

酸、有機溶媒は不可。
 
 
 

 

fee
真空冷凍乾燥機 RFD-10MS
Hitachi
Laboratory Freeze Dryer
Model RFD-10MS
東京都千代田区丸の内一丁目6番6号
電話 03-3258-1111
URL:http://www.hitachi-hitec.com/index.html

購入日:1988年3月
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室 
 

試料を凍結させたまま真空中で水分を昇華させます。
熱を加えず常温で乾燥します。
棚冷却ができます。
酸、有機溶媒は不可。
 
 
 

 

fee
真空冷凍乾燥機 FDU-830
TOKYO RIKAKIKAI
Freeze Dryer
Model FDU-830
東京都文京区小石川1-15-17 TN小石川ビル6F
電話 03(6757)3377
URL:http://www.eyela.co.jp/index.shtml

2009年9月供用換え
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室 
 

酸、有機溶媒は不可。
 
 
 
 
 
 
 

 

fee
真空冷凍乾燥機 FD-1-54
HALL
Laboratory Freeze Dryer 
Model FD-1-54
URL:

購入日:1976年1月
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室 
 

ガラストラップを使用するため酸、有機溶媒も可。
(-50℃程度でトラップできるものに限る)

fee

 

 

遠心濃縮機 CC-101
TOMY
Centrifugal Concentrator
CC-101
東京都練馬区田柄3-14-17
電話 03-5987-3111 
URL:http://bio.tomys.co.jp/

購入日:1989年10月
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室
 

液体サンプルを遠心しながら減圧乾燥します
減圧は水流ポンプを使うため酸なども対応可能
ヒーターを内臓するため室温乾燥か加温乾燥が選べます
ローターは1.5mlチューブ用(Max60本)と15mlチューブ用(Max24本)があります
 
 
 

 

fee
製氷機 FM-340AK
Hoshizaki
購入日:2015年4月
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(正面)
 

クラッシュアイスをつくります
無料で使用できます
 

製氷機 F-550AWF
Hoshizaki
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室 
 

クラッシュアイスをつくります
無料で使用できます

 

fee
FM-340AK、F-550AWFもほぼ同形
 

 

超純水製造装置 Elix5+Milli-Q
Millipore
2015年3月供用換え
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(流し横) 
 

RO+EDI方式で純水(Elix水)をつくります
60LタンクがあるためElix水の大量採水が可能です
Elixの後にMilli-Qが接続されていますのでMilli-Q水も採水できます
Elix水、Milli-Q水ともに有料です
 

超純水製造装置 Direct-Q
Millipore
設置場所:融合棟5F 核酸解析室(流し横) 
 

水道水→RO膜透過→イオン交換の順に超純水をつくります
RO水、イオン交換水ともに採水できます
タンクの制限により一度に4L程度しか採水できません
有料です
 
 
 

 

  
fee
fee
純水製造装置 WG-25
Yamato
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室 
 

イオン交換→蒸留の順に純水をつくります
イオン交換水、蒸留水ともにタンクにたまったものを採水できます
イオン交換水は随時補給されますが、
蒸留水はタンクの制限により一度に約20Lまでしか採水できません
無料で使用できます
 

純水製造装置 WA-33
Yamato
設置場所:融合棟5F 分光分析室(入口左側) 
 

蒸留→イオン交換の順に純水をつくります
蒸留水、イオン交換水ともに採水できます
こちらは蒸留水はタンクに貯まったものですが
イオン交換水は採水直前に樹脂を通ります
タンクの制限により一度に約20Lまでしか採水できません
無料で使用できます

WG25、WA33共に2020年9月に消耗品の供給がストップします
 
 
 

 

 
fee
WA-33、WG25もほぼ同形
超低温フリーザ

MDF-394AT
Panasonic
購入日:2014年1月
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室

-80℃、横型
 

MDF-392
Sanyo
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室 

-80℃、横型
 

MDF-DC200V
Panasonic
購入日:2017年11月
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室
設置場所:基礎医学棟2F 物理化学実験室

-80℃、横型
 

MDF-382
Sanyo
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室 

-80℃、縦型
 

MDF-382AT
Sanyo
設置場所:融合棟5F 遠心分離室(右) 

-80℃、縦型(共同実験室専用)
 

MDF-190
Sanyo
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室

-80℃、横型(共同実験室専用)
フリーズドライの予備凍結用のため貸出不可
 

 


 

MDF-394AT
 

MDF-392
 

MDF-DC200V
 

MFD-382 & MDF-382AT
 

MDF-190

fee

 
 
 
 
 

 

低温フリーザ

MDF-330
Sanyo
購入日:1989年3月?
設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室

-20℃、縦型
 

MDF-437
Panasonic
設置場所:基礎医学棟1F 冷凍乾燥室

-20℃、横型
 

MDF-235
Sanyo
設置場所:基礎医学棟2F 物理化学実験室

-20℃、横型
 

C-25
Revco
購入日:1981年9月
設置場所:基礎医学棟1F フォトセンター横 

-27℃、横型

故障しました
 

MDF-330

MDF-437

MDF-235

C-25

fee

 

 

低温実験室

設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室

4℃、約2m x2.4m(プレハブ型)
 
 

設置場所:基礎医学棟2F 細胞分画実験室 

1965年3月〜
4℃、約3.3m x3.8m、結露(雨漏り)多い
H28年廃止予定のため新規の長期利用はできません
H29現在稼働中(移転が決まらないため)
2020年8月 故障していた細胞分画実験室が復旧しました 
 
 
 

 

  
コールドルーム(3F)       コールドルーム(2F)
fee
低温貯蔵室

設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室 
 

1965年3月〜
-15℃、約1.8m x1.8m
H28年廃止予定のため新規の長期利用はできません
H29年1月現在停止中
 
 

 


貯蔵室(3F)
fee

 

 

ホモジナイザー
KINEMATICA
homogenizer
Model POLYTRON PT 10-35 ?
Luzernerstrasse 147a
CH-6014 Luzern
Schweiz
Tel.: +41-41-259 65 65

設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室 
 

POLYTRON PT-K(PT10-35) ?
もらいもののため詳細不明
マニュアル等一切ありません
刃を取り付けて回すだけです。
スピード調整が若干甘いようです。
 
 
 

 


fee

 

 

超音波破砕機

設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室
 

海上電機 4280S ?
もらいもののため詳細不明
マニュアル等一切ありません

 


fee

 

 

恒温振とう機

BR-40L
TAITEC
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室
 

もらいもののため詳細不明
マニュアル等一切ありません
加温、冷却ができそうです

たぶんこれで使えるはず。
 


fee

 

 

ドライオーブン

NDO-400
EYERA
設置場所:融合棟5F 核酸解析室

最大設定可能温度 250℃
ファンの音がしないので自然対流で温める感じでしょうか?

LDO-450SM
iuchi
設置場所:融合棟5F 遠心分離室

ファンで内部の風が回ります。


 
fee

 

 

Co2インキュベーター

MCO-5ACUV-PJ
Panasonic
設置場所:融合棟5F レーザー顕微鏡室 
 

顕微鏡観察前の一時保存用に使用できます
こちらの機器を使っての培養は禁止しています

 


fee

ウイルスチェッカー

各機器にアンチウイルスを入れることができないため
共同実験室で個人のUSBメモリを使用する場合、
必ずウイルスチェッカーで検査して使用します。
チェックにはノートンアンチウイルスを使用しています。
検査が面倒な方は受付で空のUSBメモリを貸し出していますので
そちらを借りてください。
分析機器が感染した場合、使用を停止しますのでご注意ください。

検出したウイルス   よく使われていた偽装ファイル名
 
 
 

 


液体窒素分注サービス

0.5kg単位で販売します。
容器ごと貸し出しも行っています。
 
 
 

 


 
 
fee

 

核酸関連


 

細胞関連機器

設置場所:融合棟5F 細胞機能解析室2

Becton Dickinson
Cell sorter
FACS Aria3
1 Becton Drive
Franklin Lakes, New Jersey 07417-1880
URL:http://www.bdj.co.jp/index.html

FACS Aria3

fee

 


設置場所:融合棟5F 細胞機能解析室1 

Becton Dickinson
Cell analyzer
FACS Calibur
1 Becton Drive
Franklin Lakes, New Jersey 07417-1880
URL:http://www.bdj.co.jp/index.html

FACS Calibur

fee

 

Miltenyi Biotec GmbH
Flow cytometer
MACSQuant
Friedrich-Ebert-Stra?e 68,
51429 Bergisch Gladbach, Germany
Phone: +49 2204 8306-0
Fax: +49 2204 8306-235
URL:http://www.miltenyibiotec.co.jp/ja-jp/

MACSQuant 

 MACSQuantifyショートカット

MACSQuantifyをWin10にインストールすると
ショートカットができないようです。お困りの方はこちらをどうぞ。

fee

 

質量分析(蛋白)関連機器
※本社情報等違うかもしれません。ご確認ください。

設置場所:融合棟5F 蛋白・質量分析室

Agilent Technologies
LC/MS system
Agilent 1100LC/MSD Trap XCT Ultra
5301 Stevens Creek Blvd.
Santa Clara, CA 95051
United States
Phone: +1 877-424-4536
URL:http://www.agilent.com/

fee

 
 
 


設置場所:融合棟5F 蛋白・質量分析室

AB Sciex
MALDI-TOF/MS
4800 Plus MALDI TOF/TOF Analyzer
500 Old Connecticut Path
Framingham, MA 01701
U.S.A.
URL:https://sciex.com/

fee

 
 
 


設置場所:融合棟5F 蛋白・質量分析室

Agena Bioscience
MassARRAY System
4755 Eastgate Mall
San Diego, CA 92121
Phone: +1.858.882.2800
URL:http://agenabio.com/

fee

 
 
 


設置場所:基礎研究棟1F 法医学講座(利用時は法医学の方とご相談ください)

SHIMADZU
GC-MS
QP2010SE
京都市中京区西ノ京桑原町1番地
Phone:075-823-1111
URL:http://www.shimadzu.co.jp/

fee
法医学様のご厚意によりガスクロ 島津 Nexis GC-2030(FID)も利用可能です。


受付:融合棟5F
受託ペプチド合成

設置場所:融合棟5F 蛋白・質量分析室

fee


電子顕微鏡関連 問い合わせは 内7470まで
電子顕微鏡関連機器

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 


設置場所:基礎医学棟1F 第2電子顕微鏡室

fee

 


設置場所:基礎医学棟1F 第3電子顕微鏡室

fee

 


設置場所:基礎医学棟1F 第4電子顕微鏡室

fee

 


設置場所:基礎医学棟1F 第1電子顕微鏡室

fee

 
 
 

その他の機器使用料


フォトセンター 問い合わせは 内7474まで
フォトセンター機器

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

fee



ポスター原稿作成てびき
 


インターンシップ用てびき
 
 

fee

 

fee

 

fee

 

fee

 

その他の機器使用料


組織標本作製 問い合わせは 内7477まで


基礎医学棟内機器の移転場所および移転予定地

電子顕微鏡 H7650,S-3200N,S-4800 H27.5移転無→旧RI棟1F
H-7100S H27.5移転無→不明
S-2300 H27.5移転無→廃棄予定
電子顕微鏡関連前処理装置 H27.5移転無→旧RI棟1F
FD-2A H27.5移転無→廃棄予定

電子顕微鏡試料作製サービス H27.5移転無→旧RI棟2F
組織標本作製サービス H27.5移転無→旧RI棟2F

液体窒素分注サービス H27.5移転無→H27.12.1より融合棟へ移転→H29.8.1より基礎医学棟へ

フォトセンター H27.5移転無→旧RI棟3F

ペプチド合成機 H27.5移転無→旧RI棟4F(依頼は融合棟で受付しています)


融合棟内機器配置図と実験室の様子

基礎医学棟の配置図はこちら



 
 
終了した機器
 蛍光イメージアナライザー モレキュラーダイナミクス   Fluor Imager SI Specifications 

デンシトメーター モレキュラーダイナミクス  300SX

ELISA用吸光度測定装置 バイオ・ラッド 2550

クロマトスキャナー 島津製作所製 CS-900

電子スピン共鳴装置(ESR) 日本電子 JES-FE1XG

 フローサイトメーター ベクトンディッキンソン FACScan

アミノ酸分析計 日立 L-8500

分光光度計 日立 557 

冷凍乾燥機 LABCONCO FD4.5

超低温フリーザ Sanyo MDF-U581

分光光度計 Beckman DU-640

セルソーター BD FACSAria1
 

Nikon N-SIMデモ跡地(2015.11.11〜2016.1.13)

オリンパス FV3000実機デモのご案内(2016/11/14-11/25)跡地

最先端イメージングセミナー&ANDOR Dragonflyデモ(2018/6/26〜2018/7/3)跡地



【非公式】予約状況と機器一覧

※個人の覚書です。リアルタイムな予約状況ではありません。正確な予約状況と予約は 内7472まで。
カレンダーは公式なものではありませんので、更新状況、内容等について共同実験室に問い合わせないようお願いします。

【】はカレンダー名(予定リスト内の表記)、1つのカレンダー内に関連する複数の機器の予約が入っています。予定リストを必要なものだけにすると見やすくなります。

核酸関連
 【3130xl】
  (3130) = DNAシーケンサ 3130xl
  無印= DNAシーケンサ Prism3100

 【310】
  無印 = RTPCR StepOnePlus
  (310) = DNAシーケンサ Prism310
 
 
 
 

Reset


顕微鏡関連
 【BZ X-700】
  無印 = オールインワン顕微鏡 BZ X-700

 【LSM510】
  無印 = 倒立レーザー顕微鏡 LSM780
  (510) = 正立レーザー顕微鏡 LSM510

 【LSM510他】
  無印 = 実体顕微鏡 SZX-12
  (imaris) = 解析ソフト IMARIS7

 【顕微鏡】
  (IX) = 倒立顕微鏡 IX-71
  (AP) = 正立顕微鏡 AxioPhot
 


遠心機関連
 【XL-80】
  無印 = 超遠心機 L-70K
  (XL)= 超遠心機 XL-80

 【XL-80他】
  (L8) = 超遠心機 L8-70M
  (85H) = 超遠心機 SCP-85H
  (TL-100) = 微量超遠心機 TL-100

 【7930】
  無印 = 高速遠心機 7780
  (MRX) = 高速遠心機 MRX-150
 


その他
 【光度計】…光度計関連
  無印 = 分光光度計 DS-11+
  (ND) = 分光光度計 ND-1000
  (DU7400) = 分光光度計 DU-7400
  (FL) = 蛍光光度計 650-10S
  (Z9000) = 原子吸光光度計 Z-9000

 【その他】
  無印 = プレートリーダー FlexStation3
  (NEON) = 遺伝子導入装置 NEON
  (FD) = 凍結乾燥機

 【鍵貸出簿】…フリーザ使用状況
  (394)(392)(382)(200V) = -80℃フリーザ
  (437)(330)(235)(rev) = -20℃フリーザ
 


管轄外
 【FCM】…フローサイト関連
  無印 = MACSQuant
  (Ca) = FACS Calibur
  (Aria) = FACS Aria3

電顕関連
 【TEM】…透過電顕
  無印 = H-7650
 【SEM】…走査電顕
  無印 = S-4800
 【ミクロトーム】
  無印 = ミクロトーム
 【クリオスタット】
  無印 = クリオスタット
 【蒸着】
  (C) = カーボン蒸着
  (Os) = オスミウムコーター
  (親水) = 親水処理


カレンダーサイズ:pix pix 
全カレンダー表示