自然科学研究机构分子科学研究所
冈山大学
综合研究大学院大学

◆发表要点

• 转运蛋白通过切换自身的结构将特定分子转运到细胞内外
  
• 通过分子模拟和结构预测AI AlphaFold2，成功预测了草酸转运体未阐明的内开放结构及其促进结构变化的重要氨基酸残基
  
• 分子模拟与结构预测AI相结合的此次方法，今后有望应用于各种转运蛋白的未阐明结构研究
  

【概要】
自然科学研究机构·分子科学研究所的大贯隼助教、Jaunet-Lahary特任研究员、冈崎圭一副教授和冈山大学学术研究院医齿药学域（药）的山下敦子教授的研究小组，通过分子动力学模拟和结构预测AI的AlphaFold2，明确了肠内草酸分解菌所具有的转运蛋白的未阐明结构及其重要氨基酸残基。
本研究成果在国际学术杂志《The Journal of Physical Chemistry Letters》上于2024年1月12日在线刊登。

■论文信息
刊登：The Journal of Physical Chemistry Letters
论文题目：
“Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Uncover a Missing Conformational State of Transporter Protein OxlT”
（“Accelerated分子动力学方法和AlphaFold揭示转运蛋白OxlT的未阐明结构”）
作者：Jun Ohnuki, Titouan Jaunet-Lahary, Atsuko Yamashita, and Kei-ichi Okazaki
刊登日期：2024年1月12日（在线公开）
DOI：10.1021/acs.jpclett.3c03052

■研究支援
本研究是在日本学术振兴会·科学研究费补助金（青年研究JP23K14160，基础研究（B）JP22H02595），公益财团法人·长濑科学技术振兴财团的支援下实施的。另外，本研究的分子模拟和AlphaFold2的结构预测一部分使用了自然科学研究机构冈崎共同研究设施·计算科学研究中心（课题编号：22-IMS-C189，23-IMS-C201）。
＜详细研究内容＞
分子模拟×用AI阐明转运蛋白的未阐明结构

＜咨询窗口＞
　　冈崎　圭一
　　分子科学研究所・计算科学研究中心 / 综合研究大学院大学、副教授
　　TEL：0564-55-7468

　　山下　敦子
　　冈山大学学术研究院医齿药学域（药）、教授
　　TEL：086-251-7974

＜报道担当＞
　　自然科学研究机构・分子科学研究所　研究力強化战略室　宣传担当
　　TEL：0564-55-7209　FAX：0564-55-7340

　　国立大学法人冈山大学总务・企画部宣传课
　　TEL：086-251-7292　FAX：086-251-7294

　　综合研究大学院大学 综合企画课　宣传社会合作係
　　TEL：046-858-1629