分子遺伝学研究室（阿保達彦・茶谷悠平）

細胞内における翻訳システムの健全性維持機構を，主にバクテリアの系を用いて研究しています。

生体超分子構造研究室（沈建仁・菅倫寛・秋田総理・齋藤恭紀・中島芳樹）

光合成などに関わる膜タンパク質の機能と立体構造を原子のレベルで明らかにする研究を行っています。

植物発生研究室（高橋卓・本瀬宏康・岡本崇）

主にシロイヌナズナとゼニゴケを用いて，植物の発生を研究しています。特に維管束形成におけるサーモスペルミンの働き，表皮細胞に特異的な遺伝子発現，細胞の成長極性を制御するタンパク質の各分子機構について，最先端の研究を展開しています。

分子発生制御研究室（上田均　特任教授）

ショウジョウバエのホルモンの役割や生物タイマーの分子機構を解析することで，変態開始や羽化などのタイミングの決定機構を研究しています。

分子機能研究室（中越英樹）

細胞機能が獲得されるしくみ，体内恒常性を維持する機構について，ショウジョウバエを用いて研究しています．

分子内分泌学研究室（竹内栄・相澤清香）

マウスやラット，ニワトリやウズラ，ネッタイツメガエルやメダカを用い，ホルモンや細胞成長因子によるさまざまな生体制御のしくみを研究しています。

時間生物学研究室（吉井大志）

ショウジョウバエを用いて体内時計の分子・神経メカニズムの研究をしています。

神経行動研究室（坂本浩隆＊・越智拓海＊・御輿真穂）（2024.04.01新任）

生殖に関わるなど、社会行動の神経・内分泌制御
我々ヒトにおいて、個体の性は性ステロイドホルモンの作用により胎児期に不可逆的に決定されます。この決定は成体では、可塑性（やわらかさ）が極めて低くなってしまい、成熟後、性転換することはありません。一方、魚類は成熟期においても環境―ホルモンにより完全な性転換を起こすとこができる唯一の脊椎動物です。これら多様な生物で比較し、性分化にみられる「やわらかさ」について、特に脳に着目して、制御分子～神経コネクトーム～アウトプットの行動までの包括的研究をしています。

臨海実験所／文部科学省共同利用拠点UMI（坂本竜哉・安齋　賢・秋山貞・濱田麻友子）

瀬戸内海は世界的に最も有名な内海で，極めて大きい干満差が特徴的です。さらに牛窓海域は，海で誕生した生命が淡水や陸上へ進出したとされる汽水干潟の多様な生体制御機構を有す生物相に恵まれています。この豊かなリソースを背景に，行動神経内分泌など生体制御学を中心とした分野でユニークな新知見を見出しています。さらに，海産生物のみならず，メダカ，ラットなど脊椎動物全般のモデル生物も駆使し，分子-細胞-組織-個体-生態系を統合させて究明を行い，普遍的核心に迫っています。

器官再構築研究室（佐藤伸）

様々な動物を使用して器官レベルの再生の研究をしています。再生だけではなく四肢・尻尾の発生や，再生能力の進化などを研究しています。

植物進化生態学研究室（三村真紀子・中堀　清）

(1)環境変動に対する植物の進化的応答，（2）適応進化と種分化に関わる集団的遺伝学，について研究しています。