310

ABI PRISM3100は2007年6月に3130xlにバージョンアップしました。
現在、310はフラグメント解析用に
3130xlはシーケンス用に使用しています。
機器の簡易マニュアルはこちらに集まっています
**DNAシーケンサー**
Applied Biosystems 310 Genetic Analyzer Applied Biosystems Division Headquarters 850 Lincoln Centre Drive Foster City, CA 94404 U.S.A. Phone: 650-638-5800 800-327-3002 Fax: 650-638-5884 URL:http://www.appliedbiosystems.com/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室 36cmキャピラリーPOP4で使用中（借用品）2014年8月返却済み 2014年11月　中古機の稼働開始しました 2020年3月にメーカーサポートが終了になります。 310の消耗品についても終了となるようです。	fee Prism310
Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer Applied Biosystems Division Headquarters 850 Lincoln Centre Drive Foster City, CA 94404 U.S.A. Phone: 650-638-5800 800-327-3002 Fax: 650-638-5884 URL:http://www.appliedbiosystems.com/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室 50cmキャピラリーPOP7で使用中読み取り塩基数　約600base@1h （2002年12月 Prism3100購入、2007年6月 3130xlへバージョンアップ） 2021年3月にメーカーサポートが終了になります。 2021年3月以降は修理部品がなくなり次第終了となるようです。消耗品についてのアナウンスは今のところありません。現在の共同実験室の方針は消耗品を買い置きしておいて 2台の3130xlを使えるところまで使うようです。機器更新の予定はありません。	fee 　　　　　　3130xl　　Sequence Scanner
Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer Applied Biosystems Division Headquarters 850 Lincoln Centre Drive Foster City, CA 94404 U.S.A. Phone: 650-638-5800 800-327-3002 Fax: 650-638-5884 URL:http://www.appliedbiosystems.com/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室 50cmキャピラリーPOP7で使用中読み取り塩基数　約700base@1h ~~, 約850base@2h~~ （2009年12月購入） 2021年3月にメーカーサポートが終了になります。 2021年3月以降は修理部品がなくなり次第終了となるようです。消耗品についてのアナウンスは今のところありません。	fee 　　　　　　3130xl　　　Sequence Scanner
遺伝情報処理ソフト Genetyx GENETYX CORPORATION 東京都渋谷区渋谷3丁目8番12号 TEL 03(3406)3241 (代表) FAX 03(3406)4881 URL:http://www.genetyx.co.jp/ 核酸・アミノ酸配列入力編集、インターネット検索支援、論文作成支援等に利用できます。 2013年から導入されました。 Windows,Mac両対応。医歯薬所属の方はアカウント申請すれば使用可能になります。 ~~使用料は無料です。~~ 2015年から統括センターのサーバー使用料有料化に伴い Genetyxの使用が有料になりました。（年度途中から申請されても割引はありません）アカウント申請はこちらから。 2018年以降はライセンス契約が終了するため、現行バージョンを継続使用する方針になりそうです。サーバーOSのサポート期間の関係で2023年で完全終了になる可能性が高いです。更新契約が終了しました。最終バージョンでの継続使用は可能ですが、以後のバージョンアップはありませんのご注意ください。 Windows版 ver14 (Win7,8.1,10対応) Mac版 Ver19 (OS X v10.11以降) 最新verが対応するかは不明	fee

**核酸関連機器**
DNA Micro Array Scanner Agilent Technologies URL:http://www.home.agilent.com/agilent/home.jspx?cc=US&lc=eng 設置場所：微量成分分析室→（移転予定地）旧RI棟3F　機器分析室2 （詳細不明）専用のマイクロアレイスライドを読み込むスキャナです。１スライド上で最大244kの遺伝子を識別可能。ハイブリ用専用オーブン付属。共同実験室には解析用ソフトがありませんのでスキャン後は各自で解析して下さい。（2010年2月購入）	fee
StepOnePlus Realtime PCR Applied Biosystems URL:http://www.appliedbiosystems.com/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室 0.1ml 96ウェルファストプレートタイプのリアルタイムPCR。長寿命LED(470～480nm)で励起し、蛍光4色を検出可能。（FAM,SYBR Green,JOE,VIC,NED,TAMRA,ROX。ただし同じ色は同時に使えません。） Fastモードの実験系を用いることで約40分のランが可能。 ※ただし、SYBR Greenはメルティングカーブ作成に時間がかかるので Fastモードの恩恵はあまりありません。各社の試薬が使用できますが、不要なトラブルを避けたい場合は ABI純正試薬、消耗品をご使用ください。試薬、消耗品は各自ご用意ください。ファストプレート、プレートシール、シングルチューブは共同実験室でも買い置きしていますので必要な方はご相談ください。ちなみに逆転写(RTPCR)は普通のサーマルサイクラーで可能です。 ~~ABI社のHPよりソフトウェアのダウンロードができます。~~ ~~（ダウンロード時機械SNが必要になりますので~~ ~~事前に共同実験室で聞いてください）~~ 新しいバージョン(v2.3)ではトラブルがあるようなので共同実験室でコピーをお持ち帰りください。（2009年12月購入）	fee 　　 StepOnePlus
Veriti Thermal Cycler Applied Biosystems URL:http://www.appliedbiosystems.com/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室 0.2ml PCR チューブ（ドーム型キャップ）または 96ウェルプレート対応　ペルチェ一体型サンプルブロック（銀）を搭載オイルフリーPCR が可能タッチスクリーンオペレーション６連独立ペルチェブロックで複数のＰＣＲを同時実行可能（グラジェント機能に似ていますが、こちらの機能は16サンプル毎に別々のきっちりしたアニーリング温度を設定します。）（2008年3月購入）	fee Veriti
GeneAmp PCR System 9700 Applied Biosystems URL:http://www.appliedbiosystems.com/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室 0.2ml PCR チューブ（ドーム型キャップ）または 96 ウェルプレート対応　ペルチェ一体型サンプルブロック（銀）を搭載オイルフリーPCR が可能（2002年12月購入）	fee
Neon Transfection System invitrogen URL:http://www.invitrogen.jp/ 設置場所：融合棟5F　分光分析室エレクトロポレーシュンによる遺伝子導入装置です。細胞に確実にダメージがありますので他の導入方法も検討した上でご使用ください。プロトコールにある細胞なら必要な細胞数とＤＮＡを用意し、付属の試薬で溶かし、電圧等の設定を入力してボタンを押すだけの簡単操作です。逆にプロトコールに無いものは条件だしにかなり手間がかかります。利用者からの報告ですが他の方法で入りにくかった浮遊細胞に比較的よく入ったそうです。共同実験室には共同利用できる培養設備がないため装置一式の貸し出しを行っています。（操作を共同実験室で行う場合は、設備のない実験室で導入後、ご自身のインキュベーターに持ち帰っていただくことになります。） ~~消耗品は用意していますがコンタミの危険性が高いため各自での購入をお奨めします。~~ 試薬は各自でご購入ください。スタンドからのコンタミが気になる方には本体（電源部）のみの使用も可能です。こちらにプロトコールがあります。（2009年11月購入）消耗品買い取りプランはなくなりました	fee
Countess Automated Cell Counter invitrogen URL:http://www.invitrogen.jp/ 設置場所：融合棟5F　分光分析室トリパンブルー染色された細胞を専用スライドにセットし生細胞と死細胞をカウントするセルカウンターです。画像データ、計測データをUSBメモリに保存できます。消耗品はこちらのものが流用できるそうです。（純正より安いそうです）（2009年11月購入）	fee fee
ND-1000 Spectrophotometer NanoDrop Technologies URL:http://www.nanodrop.com/ 設置場所：融合棟5F　分光分析室最小1ulで測定可能 2-3700ng/ulの二重鎖DNAが定量可能 DNA,RNA,タンパク等の定量モードを備えるが ~~核酸定量専用機として使用中~~ 蛋白も使用可能にしました上記のリンク先の support-Nanodrop1000-softwareからソフトをダウンロードし、データビューワーとして使用可能（2006年7月購入）	fee 　　 Nanodrop
High Speed Refrigerated Centrifuge 7780 KUBOTA corporation URL:http://www.kubotacorp.co.jp/ 設置場所：融合棟5F　核酸解析室マイクロプレート、0.2ml PCRチューブの遠心が可能（プレート使用時最大4390×g）（2004年7月購入）	fee 　　　　　　　高速遠心機
Superior Sample Preparation SAVANT 減圧遠心濃縮機ですＤＮＡ／ＲＮＡのエタノール沈殿物、アンモニア水中の合成オリゴマー等、微量試料の乾燥が行えますローター：RD24 1.5ml×24本温度：室温、約３７℃、約６０℃から選択（1994年3月購入）	fee
PLATE FUGE C2000 Greiner bio-one マイクロプレート専用遠心機ですスピンダウンするなら7780より楽です（2017年3月購入）	使用料金 : 無料