(旧)裏メインページ<非公式>
公式が新しくなったためあまり意味はありません。
公式が物足りないので作っちゃった…
管理者のメモ書きです、、、
お知らせ
共同実験室の機器の補足説明 (自分のわかる範囲で説明します)
機器の簡易マニュアルはこちらに集まっています
(下記説明欄の本アイコンからもダウンロードできます)
説明欄のPCアイコンは専用ソフトのダウンロードができます
Quick Link
顕微鏡関連 レーザー顕微鏡 オールインワン顕微鏡 蛍光顕微鏡 実体顕微鏡 Imaris 各種ソフトウェアOS対応状況
遠心機関連 超遠心機 冷却高速遠心機
光度計関連 分光光度計 蛍光光度計 マルチプレートリーダー 蛍光スキャナー
核酸関連 DNAシーケンサー Genetyx DNAマイクロアレイ リアルタイムPCR サーマルサイクラー 遺伝子導入装置
細胞関連 セルソーター フローサイトメーター セルカウンター
蛋白関連 LC-MS TOF-MS Mass
Array GC-MS ペプチド合成機 液クロ
電顕関連 透過電子顕微鏡 走査電子顕微鏡 ミクロトーム 蒸着装置
フォトセンター 大型ジェットプリンタ スキャナ ビデオコピー X線フィルム自動現像装置 証明写真作成
組織標本作製 パラフィンブロック作製 薄切 染色
その他、設備等 凍結乾燥機 濃縮遠心機 製氷機 純水製造装置 フリーザー 低温実験室 ウイルススキャン
共焦点レーザー顕微鏡 LSM780
CarlZeiss Confocal Laser Scanning Microscope LSM780 Carl-Zeiss-Promenade 10 07745 Jena, Germany Phone: +49 3641 64-0 Fax: +49 3641 64-2856 URL:http://www.zeiss.de/ 2022年9月サポート終了の為、以降修理不能
使用前に2時間程度の講習を受けていただく必要があります。
レーザー顕微鏡は蛍光顕微鏡にレーザー検出器が付いたものです。
<特徴>
<詳細>
目視用透過光源:ハロゲンランプ
この装置で使用できそうな蛍光色素(条件的にやや不利なものを含んでいます)
ユーザーからの報告でRhodamine,Cy3,TRITC,Alexa555はLSM510の方がむいているようです。
こちらに蛍光色素のスペクトルを確認できるHPがあります。 蛍光色素についてはメーカー等により若干スペクトル特性が変わります。
2020/12/22
2020/8/27
2019/6/27
2018/5/25現在 ZEN2.3のサイズが7GBになっていました。
2017/9/6現在 ZEN 2.3SP1 Black editionが公開されています。
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LSM780(本体)
ZEN 2012がインストールできない方は
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臨海実験所の多光子レーザー顕微鏡を見てきました。
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共焦点レーザー顕微鏡 LSM510
CarlZeiss Confocal Laser Scanning Microscope LSM510 Carl-Zeiss-Promenade 10 07745 Jena, Germany Phone: +49 3641 64-0 Fax: +49 3641 64-2856 URL:http://www.zeiss.de/ メーカーサポート終了のため故障時修理不可
使用前に2時間程度の講習を受けていただく必要があります。
<特徴>
<詳細>
この装置で実際に使用された蛍光色素(黄字は条件的に不利なもの)
測定中にLSM透過像の明るさが変わる持病を持っています(蛍光像は問題有りません)
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LSM510 |
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オールインワン蛍光顕微鏡 BZ-X700
KEYENCE All-in-one Fluorescence Microscope BZ-X700 大阪市東淀川区東中島1-3-14 URL:http://www.keyence.co.jp/ 購入日:2014年10月
倒立顕微鏡
特殊なフィルターは各自ご用意ください。
ハイブリッドセルカウントソフト搭載
筐体が簡易暗室のようになるため暗室不要。
ハイブリッドセルカウントを使用し、細胞数のカウント、面積、輝度値等の定量測定が可能。
プレパラート、ディッシュ、マルチプレートが使えるCO2チャンバー。
メーカーHPより解析ソフトの180日体験版がダウンロードできます。
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BZ-X700 |
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蛍光実体顕微鏡 SZX12
OLYMPUS CORPORATION stereoscopic microscope SZX12 東京都新宿区西新宿2-3-1 新宿モノリス Phone: (03) 3340-2111 URL:http://www.olympus.co.jp/jp/ 購入日:2003年7月
7〜90倍(無段階)での透過、落斜明視野像及び落斜蛍光像の取得が可能
memo:DP-BSWはWin7でも動作しそう
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SZX12 & CCDカメラ |
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倒立蛍光顕微鏡 IX71
OLYMPUS CORPORATION Inverted Microscope IX71 東京都新宿区西新宿2-3-1 新宿モノリス Phone: (03) 3340-2111 URL:http://www.olympus.co.jp/jp/ 2022年9月サポート終了の為、以降修理不能 購入日:2002年2月
対物レンズ:
フィルター:
4〜60倍での明視野、位相差、蛍光観察が可能。
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IX71 & CCDカメラ |
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正立蛍光顕微鏡 Axiophot
CarlZeiss Upright Microscope Axiophot Carl-Zeiss-Promenade 10 07745 Jena, Germany Phone: +49 3641 64-0 Fax: +49 3641 64-2856 URL: http://www.zeiss.de/ 購入日:1997年3月
対物レンズ:
フィルター:
5〜100倍での明視野、位相差(10x〜100x)、蛍光観察が可能
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Axiophot & CCDカメラ |
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細胞タイムラプス顕微鏡 CytoWatcher
FL
ATTO Time-lapse live cell imaging system WSL-1800-B CytoWatcher FL 東京都台東区元浅草3-2-2 Phone: 03-5827-4861 Fax: 03-5827-6647 URL: https://www.atto.co.jp/ 購入日:2020年10月
対物レンズ:4倍固定(デジタルズーム1〜4倍)
蛍光ユニット
小型簡易顕微鏡のため普段お使いのCo2インキュベーターに入れて
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CytoWatcher |
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ビジュアライゼーションソフト Imaris
BITPLANE 3D Data Visualization Imaris Badenerstrasse 682 CH-8048 Zurich Switzerland URL:http://www.bitplane.com/ 購入日:2001年2月(Imaris3)、2013年2月(Imaris7)、2020年9月(Imaris9.6)
Imaris9.6(Windows)
Imaris7 (Windows)
2015年2月〜
2015年5月〜
2020年9月〜
設置時に他バージョンのOSでも動作を確認してみました。
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OS対応状況 ◎…メーカー対応確認済 ○…共同実験室では動作 △…一部難あり ×…動作不可
Imaris7(Zeissレーザー顕微鏡用立体構築ソフト)
ZEN(Zeissレーザー顕微鏡用ビューア) free
※ZEN2012はWin10にインストールできる場合とできない場合がありました。 2019/6/27 ZEN 3.0が出ていました。2.3より安定していましたが短時間使用の為、詳細不明です。 2020/12/22 Black editionの配布がなくなったようです。 BZ-X Analyzer(BZ-X700用解析ソフト)180日体験版
手順はこちら ND-1000(Nanodrop用データビューア) free
SoftMaxPro5.4(FlexStation3用解析ソフト)
SequenceScanner(DNAシーケンサー用データビューア) free
Win8.1はエラーがでますが、msvcp71.dllを入れると使えます。 StepOneSoftware(リアルタイムPCR用解析ソフト) free
Genetyx(遺伝子解析ソフト)
FlowJo(フローサイト用解析ソフト)
FCAP Array(フローサイト用解析ソフト)
MACSQuantify(フローサイト用解析ソフト)
ImageLab(ChemiDoc用解析ソフト)
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----- 以下SGI用の旧バージョンソフトです -----
SGI O2も設置されていますので以下のソフトも使用可能です。
2020.09.17
バージョンアップグレードに伴いImaris3及びNeuronTracerは削除されました。
後継はWindows版Imaris9.6,ImarisMeasurementPro,FilamentTracerになります。
Imaris3 (SGI)
SGI Irix上で動作する旧バージョンのImaris
複雑な動画が作成できませんが、オブジェクトの体積を計算する機能があります
古いシステムのため大きな画像は扱えません
Neuron tracer (SGI)
Zスタック画像から解析用モデルをつくり、樹状突起のつながりを
調べるソフトのようですがあまりうまくいきません
Huygens (SGI)
LSM510用のデコンボリューション処理を行うソフト
Zスタック画像からボケを除去します
かなり時間がかかります
古いシステムのため大きな画像は扱えません
LSM780の画像にはあまり効果がないようです
超遠心機 L70K
BECKMAN Ultracentrifuge Optima L70K Beckman Coulter, Inc. Corporate Headquarters 4300 N. Harbor Boulevard P.O.Box 3100 Fullerton, CA 92834-310 URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/ 購入日:1998年3月
最高回転数:70,000 rpm
保有ローター … ANGLE型 Type70.1Ti , Type50.2Ti , 各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
ローターについて補足
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L70K |
超遠心機 XL-80
BECKMAN Ultracentrifuge Optima XL-80 Beckman Coulter, Inc. Corporate Headquarters 4300 N. Harbor Boulevard P.O.Box 3100 Fullerton, CA 92834-310 URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/ 購入日:1994年3月
最高回転数:80,000 rpm
保有ローター … ANGLE型 Type70.1Ti , Type50.2Ti , 各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
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XL-80 |
超遠心機 L8-70M
BECKMAN Ultracentrifuge Model L8-70M Beckman Coulter, Inc. Corporate Headquarters 4300 N. Harbor Boulevard P.O.Box 3100 Fullerton, CA 92834-310 URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/ 購入日:不明
最高回転数:70,000 rpm
保有ローター … ANGLE型 Type70.1Ti , 各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
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L8-70M |
超遠心機 SCP85H
2021.02.05 ドライブ損傷し使用不能となりました Hitachi Ultracentrifuge Model SCP85H 東京都港区港南二丁目15番1号(品川インターシティA棟) 電話(03)5783-0601 URL:http://www.hitachi-koki.co.jp/index.html 購入日:不明
最高回転数:85,000 rpm
保有ローター … ANGLE型 RP80T-3 , RP55T , RP50-2 , RP45T , RP70T , RP83T
各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
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SCP85H |
超遠心機 80P-7
Hitachi Ultracentrifuge Model 80P-7 東京都港区港南二丁目15番1号(品川インターシティA棟) 電話(03)5783-0601 URL:http://www.hitachi-koki.co.jp/index.html 購入日:1979年2月
最高回転数:80,000 rpm
保有ローター … ANGLE型 RP80T-3 , RP55T , RP50-2 , RP45T , RP70T , RP83T
各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
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微量超遠心機 TL-100
BECKMAN Ultracentrifuge Model TL-100 Beckman Coulter, Inc. Corporate Headquarters 4300 N. Harbor Boulevard P.O.Box 3100 Fullerton, CA 92834-310 URL:http://www.beckmancoulter.co.jp/ 購入日:1989年3月
最高回転数:100,000 rpm
保有ローター … ANGLE型 TLA-100.3 , TLA-100.2 各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
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TL-100 |
冷却高速遠心機 7780U
KUBOTA High Speed Refrigerated Centrifuge 7780U 東京都文京区本郷3-29-9 Tel:03-3815-1331 Fax:03-3814-2574 URL:http://www.kubotacorp.co.jp/ 購入日:2010年8月
最高回転数:22,000 rpm
保有ローター … RA-150,RA-300G,RA-1500,AG-6512C
各ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい
AG-6512C,RS-720Gは汎用50ml,15mlコニカルチューブ使用可能
チューブは各自で用意する(共同実験室で購入も可能)
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7780U |
冷却高速遠心機 MRX-150
TOMY High Speed Refrigerated Centrifuge MRX-150 東京都練馬区田柄3-14-17 TEL.03-5987-3111 FAX.03-3577-1655 URL:http://bio.tomys.co.jp/ 購入日:不明
保有ローター … TMA-4
ローターのチューブサイズやgはこちらを参照して下さい チューブは各自で用意する 1.5mlマイクロチューブ専用機。
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密度勾配作製装置 グラジェントマスター106
Biocomp gradient forming instrument Gradient Master Model 106 URL: 購入日:2004年3月
チューブを傾けて回転させることで密度勾配を作製します
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分光光度計 DU-7400
Beckman Spectrophotometer DU-7400 URL: 購入日:1994年3月
測定範囲190nm-800nmの分光光度計
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DU-7400 |
分光光度計 DU-640
Beckman Spectrophotometer DU-640 URL: 購入日:不明
DU-7400の下位機種
故障しました
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DU-640 |
微量分光光度計 DS-11+
DeNovix Spectrophotometer DS-11+ 3411 Silverside Rd Hanby Building Wilmington, DE 19810 USA phone +1 302 442 6911 URL:http://www.denovix.com/ 購入日:2016年8月
DU-7400とNanoDropの後継機種として購入
光源:キセノンフラッシュ
DNAやタンパクの定量モードを備える
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DS-11+ |
微量分光光度計 ND-1000
NanoDrop Technologies Spectrophotometer ND-1000 URL:http://www.nanodrop.com/ メーカーサポート終了のため故障時修理不可
最小1ulで測定可能
光源:キセノンフラッシュ
上記のリンク先の
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ND-1000 |
マルチプレートリーダー FlexStation
3
Molecular Device MULTI-DETECTION READER Flex Station 3 1311 Orleans Drive Sunnyvale, CA 94089-1136 U.S.A. Phone: (U.S.) 800-635-5577 URL:http://www.moleculardevices.com/home.html 購入日:2009年11月
吸光、蛍光、発光、時間分解蛍光、蛍光偏光測定のできるプレートリーダー
プレートを測るだけだと非常に簡単に使用できるためお奨めです。
時間分解蛍光はあまり細かい設定はできません。
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FlexStation3 |
分光蛍光光度計 650-10S
Hitachi Florence Spectrophotometer Model 650-10S 東京都千代田区丸の内一丁目6番6号 電話 03-3258-1111 URL:http://www.hitachi-hitec.com/index.html 購入日:1983年3月
感度:10 mm セル、励起光 350 nm 、バンドパス両分光器とも10nm において
分光された励起光を試料に当て、蛍光測定する。
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650-10S |
原子吸光光度計 Z-9000
Hitachi Simultaneaus Multi-element Analysis Atomic Absorption Spectrophoto Meter Model Z-9000 東京都千代田区丸の内一丁目6番6号 電話 03-3258-1111 URL:http://www.hitachi-hitec.com/index.html 購入日:1991年3月
測定方法:4波長ダブルビーム(偏光ゼーマン)
液体サンプル10〜40ulを2000〜3000度で原子化し、ホローカソードランプの吸収で
定量まで行うと結構時間がかかります、、、
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Z-9000 |
細胞イメージアナライザー
Cellomics ArrayScan VTI
Thermo Fisher Scientific Inc. High-Content Systems Cellomics ArrayScan VTI HCS Reader 81 Wyman Street Waltham, MA 02454 Tel: 781.622.1000 800.678.5599 Fax: 781.622.1207 URL:http://www.thermoscientific.jp/ 購入日:2010年1月
顕微鏡観察とフローサイトメーターの間の子のような性格をもつ機械。
レンズ:Fluar 5x , ECPlanNeo 10x , PlanApo 10x , LD PlanNeo 20x
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フルオロイメージアナライザー
FLA-3000 FUJIFILM Fluorescent Image Analyzer FLA-3000 東京都港区赤坂9丁目7番3号 Tel: 03-6271-1111 URL:http://fujifilm.jp/ 購入日:不明
蛍光イメージスキャナー。
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FLA-3000 |
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イメージングシステム
ChemiDoc Touch Bio-Rad Imaging System ChemiDoc Touch 1000 Alfred Nobel Drive Hercules, CA 94547 Tel: +1-510-724-7000 URL:http://www.bio-rad.com 購入日:2018年6月
仕様
ウェスタンブロットメンブレンやゲルの撮影をします。
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ChemiDoc Touch |
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真空冷凍乾燥機 FDU-2110
TOKYO RIKAKIKAI Freeze Dryer Model FDU-2110 東京都文京区小石川1-15-17 TN小石川ビル6F 電話 03(6757)3377 URL:http://www.eyela.co.jp/index.shtml 購入日:2017年8月
酸、有機溶媒は不可。
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真空冷凍乾燥機 RFD-10MS
Hitachi Laboratory Freeze Dryer Model RFD-10MS 東京都千代田区丸の内一丁目6番6号 電話 03-3258-1111 URL:http://www.hitachi-hitec.com/index.html 購入日:1988年3月
試料を凍結させたまま真空中で水分を昇華させます。
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真空冷凍乾燥機 FDU-830
TOKYO RIKAKIKAI Freeze Dryer Model FDU-830 東京都文京区小石川1-15-17 TN小石川ビル6F 電話 03(6757)3377 URL:http://www.eyela.co.jp/index.shtml 2009年9月供用換え
酸、有機溶媒は不可。
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真空冷凍乾燥機 FD-1-54
HALL Laboratory Freeze Dryer Model FD-1-54 URL: 購入日:1976年1月
ガラストラップを使用するため酸、有機溶媒も可。
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遠心濃縮機 CC-101
TOMY Centrifugal Concentrator CC-101 東京都練馬区田柄3-14-17 電話 03-5987-3111 URL:http://bio.tomys.co.jp/ 購入日:1989年10月
液体サンプルを遠心しながら減圧乾燥します
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製氷機 FM-340AK
Hoshizaki 購入日:2015年4月 設置場所:融合棟5F 遠心分離室(正面) クラッシュアイスをつくります
製氷機 F-550AWF
クラッシュアイスをつくります
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FM-340AK、F-550AWFもほぼ同形
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超純水製造装置 Elix5+Milli-Q
Millipore 2015年3月供用換え 設置場所:融合棟5F 遠心分離室(流し横) RO+EDI方式で純水(Elix水)をつくります
超純水製造装置 Direct-Q
水道水→RO膜透過→イオン交換の順に超純水をつくります
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fee
fee
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純水製造装置 WG-25
Yamato 設置場所:基礎医学棟1F スタム保存室 イオン交換→蒸留の順に純水をつくります
純水製造装置 WA-33
蒸留→イオン交換の順に純水をつくります
WG25、WA33共に2020年9月に消耗品の供給がストップします
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WA-33、WG25もほぼ同形 |
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超低温フリーザ
MDF-394AT
-80℃、横型
MDF-392
-80℃、横型
MDF-DC200V
-80℃、横型
MDF-382
-80℃、縦型
MDF-382AT
-80℃、縦型(共同実験室専用)
MDF-190
-80℃、横型(共同実験室専用)
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MDF-394AT
MDF-392
MDF-DC200V
MFD-382 & MDF-382AT
MDF-190 fee
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低温フリーザ
MDF-330
-20℃、縦型
MDF-437
-20℃、横型
MDF-235
-20℃、横型
C-25
-27℃、横型 故障しました
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MDF-330
MDF-437 MDF-235 C-25 fee
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低温実験室
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室 4℃、約2m x2.4m(プレハブ型)
設置場所:基礎医学棟2F 細胞分画実験室 1965年3月〜
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コールドルーム(3F) コールドルーム(2F) fee
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低温貯蔵室
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室
1965年3月〜
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貯蔵室(3F) fee
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ホモジナイザー
KINEMATICA homogenizer Model POLYTRON PT 10-35 ? Luzernerstrasse 147a CH-6014 Luzern Schweiz Tel.: +41-41-259 65 65 設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室
POLYTRON PT-K(PT10-35) ?
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fee
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超音波破砕機
設置場所:基礎医学棟3F 遠心分離室
海上電機 4280S ?
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恒温振とう機
BR-40L
もらいもののため詳細不明
たぶんこれで使えるはず。
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ドライオーブン
NDO-400
最大設定可能温度 250℃
LDO-450SM
ファンで内部の風が回ります。 |
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Co2インキュベーター
MCO-5ACUV-PJ
顕微鏡観察前の一時保存用に使用できます
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fee
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ウイルスチェッカー 各機器にアンチウイルスを入れることができないため
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液体窒素分注サービス 0.5kg単位で販売します。
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細胞関連機器
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設置場所:融合棟5F 細胞機能解析室2 Becton Dickinson
FACS Aria3 fee
Becton Dickinson
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Miltenyi Biotec GmbH
MACSQuantifyをWin10にインストールすると
fee
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質量分析(蛋白)関連機器
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※本社情報等違うかもしれません。ご確認ください。
設置場所:融合棟5F 蛋白・質量分析室 Agilent Technologies
fee
AB Sciex
fee
Agena Bioscience
fee
SHIMADZU
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法医学様のご厚意によりガスクロ 島津 Nexis GC-2030(FID)も利用可能です。 |
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受付:融合棟5F 受託ペプチド合成 設置場所:融合棟5F 蛋白・質量分析室 fee
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電子顕微鏡関連機器
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fee
fee
fee
fee
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フォトセンター機器
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fee
fee
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基礎医学棟内機器の移転場所および移転予定地
電子顕微鏡 H7650,S-3200N,S-4800 H27.5移転無→旧RI棟1F
H-7100S H27.5移転無→不明
S-2300 H27.5移転無→廃棄予定
電子顕微鏡関連前処理装置 H27.5移転無→旧RI棟1F
FD-2A H27.5移転無→廃棄予定
電子顕微鏡試料作製サービス H27.5移転無→旧RI棟2F
組織標本作製サービス H27.5移転無→旧RI棟2F
液体窒素分注サービス H27.5移転無→H27.12.1より融合棟へ移転→H29.8.1より基礎医学棟へ
フォトセンター H27.5移転無→旧RI棟3F
ペプチド合成機 H27.5移転無→旧RI棟4F(依頼は融合棟で受付しています)
蛍光イメージアナライザー モレキュラーダイナミクス Fluor
Imager SI Specifications
デンシトメーター モレキュラーダイナミクス 300SX ELISA用吸光度測定装置 バイオ・ラッド 2550 クロマトスキャナー 島津製作所製 CS-900 電子スピン共鳴装置(ESR) 日本電子 JES-FE1XG フローサイトメーター ベクトンディッキンソン FACScan アミノ酸分析計 日立 L-8500 分光光度計 日立 557 冷凍乾燥機 LABCONCO FD4.5 超低温フリーザ Sanyo MDF-U581 分光光度計 Beckman DU-640 セルソーター BD FACSAria1
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Nikon N-SIMデモ跡地(2015.11.11〜2016.1.13)
オリンパス FV3000実機デモのご案内(2016/11/14-11/25)跡地
最先端イメージングセミナー&ANDOR Dragonflyデモ(2018/6/26〜2018/7/3)跡地
※個人の覚書です。リアルタイムな予約状況ではありません。正確な予約状況と予約は
内7472まで。
カレンダーは公式なものではありませんので、更新状況、内容等について共同実験室に問い合わせないようお願いします。
【】はカレンダー名(予定リスト内の表記)、1つのカレンダー内に関連する複数の機器の予約が入っています。予定リストを必要なものだけにすると見やすくなります。
核酸関連 【3130xl】 (3130) = DNAシーケンサ 3130xl 無印= DNAシーケンサ Prism3100 【310】
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顕微鏡関連 【BZ X-700】 無印 = オールインワン顕微鏡 BZ X-700 【LSM510】
【LSM510他】
【顕微鏡】
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遠心機関連 【XL-80】 無印 = 超遠心機 L-70K (XL)= 超遠心機 XL-80 【XL-80他】
【7930】
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その他 【光度計】…光度計関連 無印 = 分光光度計 DS-11+ (ND) = 分光光度計 ND-1000 (DU7400) = 分光光度計 DU-7400 (FL) = 蛍光光度計 650-10S (Z9000) = 原子吸光光度計 Z-9000 【その他】
【鍵貸出簿】…フリーザ使用状況
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管轄外 【FCM】…フローサイト関連 無印 = MACSQuant (Ca) = FACS Calibur (Aria) = FACS Aria3 電顕関連
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